下面小編就來分享一下自己當初的一些經驗心得,僅代表個人看法。
先說體系配置(各組分分開,非預混液)。配置前先計算好所需要的各組分體積,統一配置好后再進行分裝。有的同學可能會心疼試劑,獨愛單孔配置方式……但對于實驗來說,一次即可順利獲取有效結果才是最大的節約。在體系的配置時需注意一下各組分的添加順序:先加ddH2O,其余組分再按體積大小依次加入。排液時,吸頭扎入液面以下排液,排出液體后嚴禁原處反復吸打潤洗槍頭(引物、酶、模板尤其需要注意)。吸頭有一定的吸附性,液體被排出后,如在原處潤洗組分會被反吸回吸頭,經過三五次的潤洗可能會使目標組分有嚴重的損失。如果想將吸頭內的組分充分轉移,換個位置去潤洗吸頭。體系混勻也需注意,可以用合適量程的移液器緩慢吹打5-10次,也可以緩慢上下顛倒混勻;如果需要用斡旋振蕩器混勻的話,轉速盡量控制在600rpm以下,轉速過快的話對酶的損傷較大,低拷貝模板的曲線是否起跳差異會比較明顯。體系分裝到pcr反應管時,移液器保持“吸一打一”的操作,不易生成氣泡。
再說實驗環境。老生常談的要在超凈工作臺內配置反應體系,生物安全柜內添加模板。超凈臺內,按照常規操作不會有太大問題;生物安全柜可是氣溶膠污染的重災區。生物安全柜內氣溶膠主要來源于加樣后的棄吸頭,生物安全柜內以循環風為主,棄吸頭內的殘留模板很容易會隨循環風彌漫整個安全柜的內環境,所以每次實驗完都需要及時把棄吸頭打包好取出安全柜。尤其遇到中午沒有完成整個實驗下午還要繼續爆肝的情況,一定要把垃圾桶內的棄槍頭清理干凈,如果沒有人使用的話就擦拭后進行紫外照射。實驗結束后的臺面清理及紫外消殺均屬基操,但需切實落實到位。
最后分享一下復孔實驗如何操作可以提高曲線的成束性。配置反應復孔時,可以參照統一配置體系的操作,將所有反應孔的模板和體系混和好再逐孔分裝。這樣可以有效降低跳孔的風險。如果是低拷貝擴增(Ct值33以后曲線起跳),就不推薦模板混入反應體系再分裝了,此時還是老老實實的逐孔加入模板更為穩妥(泊松分布影響明顯)。
此時是不是覺得自己強的可怕,迫不及待的想要實驗一把?先別急,工欲善其事,必先利其器。柏恒科技專注PCR儀16年,可為您提供各類梯度PCR儀及qPCR儀,助力您的研究!
一.儀器外部清潔
1.用潔凈毛巾或紙巾擦拭整機的外殼,將儀器挪開原先的位置,清理儀器下面的桌面的灰塵及細小的雜物,以免桌面上積攢過多導致污染頻出 。
2.檢查儀器進風口以及出風口是有遮擋或灰塵積攢,以免通風口被灰塵、纖維等雜物堵塞而造成散熱不好,從而影響儀器升降溫速度和溫控精準度,造成實驗效果不理想。
3.儀器周圍需要留出20-30厘米空間以保證良好的通風散熱,具體要求可參見儀器說明書。?
二.樣品槽清潔
1.檢查PCR儀樣品槽是否潔凈如有污染,可用蘸有75%的棉簽擦拭樣品孔,再在25℃下運行2-5min,以蒸干槽內的酒精溶液。定期清潔樣品槽,建議半年1次。
2.若是定量PCR儀,樣品孔中若被帶有熒光染料的樣品溶液污染,會影響實際樣品的檢測結果,所以更需要保證樣品槽的潔凈,建議2-3個月一次。 ? ?
三.熱蓋清潔
1.檢查熱蓋是否左右晃動,熱蓋能夠卡緊扣好,以保證程序運行過程中樣品沒有蒸發現象。
2.PCR管蓋上的記號筆標記容易在熱蓋上留下印漬,可定期用蘸有75%酒精的柔軟潔凈布進行擦拭,并將熱蓋升溫至99℃保溫3-5min,以去除酒精殘留。
四.測溫
1.樣品槽溫度的均一性和準確性關乎實驗結果的好壞,建議聯系廠家或售后由專業的售后工程師定期對儀器進行溫度測定及校準,以保證儀器溫控性能正常(尤其是使用3年以上的儀器)。
2.熒光定量pcr儀使用注意事項 ? ?
避免腐蝕性液體接觸樣品槽,以免樣品槽表面被腐蝕,造成樣品加熱不均勻。
3.避免PCR儀與冰箱等大功率儀器共用一個電源接口,大功率儀器的電流波動會導致PCR儀的運行不穩定,甚至重啟。若是定量PCR儀,會影響收集到的熒光信號強度,造成擴增曲線的波動。
4.儀器在運行過程中,禁止強行切斷電源來結束程序(突遇停電等意外除外),因為電源切斷后,風扇強制停止,導致儀器內部元器件散熱不順暢,影響元器件使用壽命。
5.如果發現儀器降溫速度明顯比正常狀態的慢,儀器發燙,或者溫度下降達不到設定的溫度,請檢查進風口和出風口是否有異物堵塞。
6.若采用PCR單管做實驗而且樣品量比較少時,為保證熱蓋平整壓在所有樣品管上,建議在樣品槽四個角放置4個同類型的空管。
7. PCR反應最后低溫保存請設置為:16℃, (切忌4℃長時間保存,避免儀器過度耗損)。
這個九月
當校園里飄起桂花香
當實驗室響起儀器輕鳴
我們為科研人準備了一份特別的開學禮——買一送六
直接把離心機和五件套開學禮包”打包”送您!
即日起至2025年9月30日
購買柏恒科技超微量分光光度計
您將獲得:
█ 免費贈送實驗室必備離心機
█ 開學尊享禮包:商務包+U盤+筆記本+商務筆+天堂傘
(從實驗設備到日常生活,全面升級您的科研體驗)
溫馨提示
1.本活動僅面向終端客戶
2.贈品隨主機一并發貨
3.每個訂單限享1套贈品,贈品數量50套送完即止
4.本活動最終解釋權歸杭州柏恒科技有限公司所有
這個開學季
讓柏恒科技為您配備最硬核的科研裝備
送上最暖心的開學禮遇
引言
PCR是分子生物學研究的基礎實驗之一,常做實驗的同學或許認為非常簡單,但對新人來說其實并不是那么友好。今天小編來分享下曾經踩過的那些坑(血淚史)……
首先,優質的模板是成功反應的前提。優質的模板需滿足以下幾點:高純度、足夠的長度、適宜的濃度。核酸純度可以用超微量分光光度計檢測的兩個比值來衡量(260/280和260/230)。當然超微量也可以檢測核酸的濃度,但不能有效反應核酸的長度。常見的動物血液、組織、或者植物組織用超微量分光光度計檢測濃度沒有問題,但石蠟包埋樣本或者石蠟切片樣本檢測就需慎重,使用超微量分光光度計檢測純度的同時需要輔助其他手段驗證其濃度是否準確,比如跑膠看一下是否有明亮光影區(包埋樣本提取的核酸在所需長度附近有明亮的片狀光影就OK了,基本沒有條帶一說)或者用染料法(Qubit)復測一下。最后再說一下適宜的濃度,擴增試劑說明書中規定模板添加體積的同時大多也會說明投入核酸的總量,這時就需要根據核酸的濃度進行簡單的計算,不足的體積用水補足,投入反應的核酸過多反而會導致非特異產物的增加。如果提取的核酸濃度過低,就只能適當的擴大添加體積,不過要適量,擴大反應體積的同時也意味著dNTPs、酶、引物等濃度的下降,進而影響擴增體系的性能。
柏恒科技超微量分光光度計在檢測核酸濃度、純度的基礎上還整合了染料法檢測功能,讓您的核酸質控無憂
其次,搭配合理的反應體系是成功反應的保障。PCR反應的五要素,除了模板其余四項都能歸入反應體系的范疇。常規的PCR實驗中,引物的濃度相對固定,所以只要找市場上口碑不差的合成公司來合成基本不會有什么問題。需要注意的是,引物如果溶了應立即分裝凍存,最小分裝量根據每次實驗所需體積自行確定。切忌引物溶解后不進行分裝,整管凍存,反復凍融個三五次后效果就會下降不少。鎂離子、DNA聚合酶、dNTPs三者的相關性較高。dNTPs會結合鎂離子,被結合的鎂離子就無法再和DNA聚合酶結合,無法激活DNA聚合酶的活性。所以鎂離子的摩爾濃度一定要大于dNTPs的總濃度,但過高濃度的鎂離子在提高酶活和產物量的同時也提高了PCR反應的錯配率。所以如果PCR反應結束后需要對產物進行測序研究就不推薦較高的鎂離子濃度。dNTPs也是類似,較高濃度有助于獲得更多的擴增產物,但也會提高反應的錯配率。至于聚合酶,現在市場化的商品更青睞于混酶(高保真酶和Taq酶混合)既兼顧擴增反應的保真又保證了最終產物的得率。概括下來,PCR的反應產物若是需要進行測序研究就推薦相對低濃度鎂離子、dNTPs的反應體系,讓堿基序列高度保真;若是僅看擴增曲線或者產物條帶的話就推薦較高濃度的鎂離子、dNTPs的反應體系,保證有更多/高的產物、信號。注:PCR反應本身存在極低的錯配率,對于分析產物的條帶大小或者qPCR的熒光信號分析不會有影響。但若進行測序分析就需要考慮將錯配率降至不影響測序結果的水平。
最后,相匹配的反應程序是成功反應的橋梁。模板在一次次的升降溫循環中完成自身的復制過程。常見的95℃變性、55℃退火、72℃延伸適用于大多數反應,可以得到所需的目標產物。但具體到某一實驗時,還需根據引物的Tm值對反應的溫度進行微調,降低非特異擴增、增加目標產物,以期達到最佳的反應效果。
柏恒科技PCR儀助力您快速確定匹配的反應程序
2025“年中奮進之旅”
—【蓄勢篇】—
七月的杭州熱情似火
柏恒人以更加熾熱的激情
開啟了2025年中奮進之旅!
在這四天里
我們以數據丈量成長
用戰略謀劃未來
憑實力加冕榮耀!
現在
讓我們一同回顧這段濃縮智慧的精彩時光!
市場戰略雙日談 Day 1-2
1 市場部年中復盤
市場部率先打響年中第一槍!通過深度復盤上半年市場表現,精準把脈行業趨勢,制定了下半年戰略。
2 市場部與研發部的碰撞
在年中跨部門頭腦風暴中,市場部與研發部的這場關于產品優化及定位的辯論,意外成為最富啟發性的思想交鋒。
“當市場敏銳度遇上技術創造力,火花就是這么耀眼!”
管理層戰略攻堅/銷售精英培訓 Day 3
部門年中匯報
核心管理層8小時高強度閉門會議:
2025年中管理層會議系統總結了公司在技術創新、市場布局、運營優化和人才建設等方面取得的突破性進展,同時明確了下半年戰略目標。
在思考的深度決定發展的高度。
銷售精英培訓
為打造一支”懂技術、精業務、善服務”的銷售狼軍,開展了產品特訓,來自全國各區域的銷售精英們華麗蛻變!
最好的銷售是能用工程師思維講產品,用客戶語言說價值。
2025下半場,市場部已準備好打一場漂亮的升級戰!
北高峰登頂行動/年中盛典 Day4
【巔峰一日】
第四天的柏恒年中盛典
將”腳踏實地”與”年中盛典”完美融合!
從北高峰的晨曦到頒獎臺的星光,
這一天注定載入柏恒史冊!
NO.1?晨光篇:北高峰登頂行動
“勇攀高峰,再創巔峰”
銷售狼軍:
早晨7:00集結,登上天下第一財神廟
財神廟前許下”業績長虹”的虔誠心愿
“每登一級臺階,都是向年度目標邁進的一步!”
拜完財神,信心滿滿!
柏恒銷售部,下半年繼續加油,
讓業績和好運一起‘噌噌’往上沖!
NO.2?午學篇:全員能力升級
在年中盛會之際,我們特別為全體員工打造了一場干貨滿滿的產品知識”充電站”!這場培訓不僅是對公司產品線的系統梳理,更是對”以客戶為中心”理念的深度踐行。
質量月活動:
“質量知識擂臺賽”上,來自各部門的代表展開了一場別開生面的智慧較量!這場競賽不僅檢驗了員工對質量標準的掌握程度,更生動詮釋了”質量就是企業生命線”的深刻內涵。
這場別開生面的知識競賽,用輕松有趣的方式達成了嚴肅的質量教育目標,為”柏質·同心”質量月活動又新增了一亮點。現在,帶著這份對質量的深刻認知,全體柏恒人已整裝待發,向著”零缺陷”的目標繼續前進!
NO.3?戰略篇:領導力時刻
全體會議上:
黃總年中總結發言:從銷售突破到生產交付,從產品升級到流程優化——我們用數據總結成長,用問題指明方向。
但比成績更重要的,是共識的力量:唯有目標同頻、思想同步,才能讓‘各自優秀’凝聚成‘團隊卓越’!
NO.4?榮耀篇:年中優秀員工表彰
2025上半程的精彩,由每一位拼搏者共同書寫!
今天,我們為閃耀的「星光」加冕——
是你們用專業鑄就標桿,以創新突破邊界;
讓平凡的工作綻放不凡的光芒!
榜樣如炬,照亮前行之路;
下半程的戰鼓已擂響,讓我們繼續——
與榮耀同行,向巔峰進發!
【預告篇】
精彩仍在繼續!明后兩天,我們將:
安吉團建之旅:趣味運動會+燒烤晚會
星空夜話:暢想柏恒美好未來
團隊拓展挑戰:勇闖浙北大峽谷
四天的沉淀,一年的能量!
所有蓄力,都是為了更好的迸發!
2025下半程,柏恒人已整裝待發!
-END-
]]>[?PCR出現雜帶的處理辦法]
—— ——
PCR(聚合酶鏈式反應)和凝膠電泳是分子生物學研究中常用的技術,它們通常結合使用以鑒定和分析PCR擴增產物。然而,在進行PCR凝膠電泳時,經常會在電泳圖譜中發現雜帶,這些雜帶可能會干擾實驗結果,甚至導致實驗失敗。
本文將探討PCR凝膠電泳過程中雜帶的成因,并提供一些可能的解決方案。
●●●
PCR條件優化: 調整PCR反應條件,退火溫度過低會導致引物與模板的非特異性結合,從而引發非特異性擴增;退火溫度過高則可能抑制引物與模板的正常結合,影響擴增效率。可以通過梯度PCR實驗逐步確定最佳的退火溫度 一般而言,PCR反應的退火步驟的溫度通常在50°C到68°C之間,具體取決于引物的堿基序列和目標DNA的特性。有些引物需要更高的退火溫度來確保特定區域的特異性結合,但一般情況下,最高退火溫度不會超過68°C。
●●●
引物設計不合理:如果引物長度過短、序列重復或含有高GC區域,可能導致引物與模板的非特異性結合,進而產生雜帶。需要重新設計引物,確保引物的長度適當、序列不重復、GC含量適中,并避免在引物內部或引物與模板的結合區域出現高GC區域。
●●●
引物用量不當:引物用量過大或特異性不高,可能會導致非特異性擴增,從而產生雜帶。建議調換引物或降低引物的使用量。
●●●
模板不純:模板DNA中含有雜質,如蛋白質、RNA或其他非目標DNA片段,可能作為PCR擴增的模板,導致額外條帶的出現。
●●●
模板降解:模板DNA在提取或儲存過程中發生降解,產生的小片段DNA可能成為非特異性擴增的模板。
●●●
純化模板DNA:PCR實驗中的模板DNA可以來自多種來源,包括基因組DNA(gDNA)、互補DNA(cDNA)以及質粒DNA等。然而,不同來源的DNA在組成和復雜度上可能有所不同,這會影響PCR擴增的最佳起始量。例如,在50 μL的PCR反應中,質粒DNA僅需0.1–1 ng,而gDNA則需要5–50 ng。此外,所使用的DNA聚合酶類型也會對最佳模板起始量產生影響。經過改造的DNA聚合酶對模板的親和力更強,靈敏度更高,因此所需的DNA起始量相對較少。優化DNA起始量至關重要,因為起始量過高可能導致非特異性擴增的風險增加,而起始量過低則可能降低PCR的得率。有時,PCR實驗方案會使用拷貝數來表示DNA起始量,特別是對于gDNA。拷貝數的計算涉及Avogadro常數和摩爾質量,具體公式為:拷貝數 = L × 摩爾數 = L ×(總質量/摩爾質量)。
●●●
Mg2?濃度過高:Mg2?是PCR反應中的重要成分,但其濃度過高會降低PCR擴增的特異性,增加非特異性擴增的風險。需要通過實驗確定最佳的Mg2?濃度。
●●●
酶的用量或質量不佳:酶的用量過高或酶的質量不好,都會影響PCR反應。建議降低酶量或更換另一來源的酶。
●●●
使用熱啟動PCR: 熱啟動PCR可以減少反應在低溫度時可能引起的非特異性擴增。
熱啟動PCR是一種用于減少非特異性擴增的技術。在常規PCR中,當反應溫度升高到擴增溫度之前,引物可能已經結合到模板DNA上。這可能導致在PCR開始階段就發生非特異性擴增,產生雜帶或假陽性結果。熱啟動PCR通過在PCR反應中添加熱穩定的DNA聚合酶來解決這個問題。
熱啟動PCR的關鍵是使用一種需要高溫激活的聚合酶。這樣的酶在較高溫度下才會變活躍,因此在反應開始時才會開始擴增目標DNA序列,而不會在低溫時引發非特異性反應。
一些常用的熱啟動聚合酶包括熱穩定的Taq聚合酶的改良版本,例如具有熱活化域的Taq DNA聚合酶,以及Pfu或Phusion等高保真度聚合酶。
所以現在的酶基本上都滿足條件。
●●●
檢查實驗室環境: 避免DNA污染及實驗儀器的污染,使用無菌技術和經過處理的試劑,保持實驗室清潔。
●●●
梯度優化PCR:使用溫度梯度進行PCR反應,尋找最適合特異性擴增的溫度。
柏恒科技智能二維梯度PCR儀可在在同一反應中同時優化變性及退火的溫度梯度變性可設橫向8行變性梯度縱向可設12列退火溫度,從而來優化最佳的退火溫度,從而提高PCR反應的特異性和效率。
這個技術對于優化引物、模板和PCR條件非常有用,以確保獲得高質量和特異性的PCR產物。
這些方法可以單獨或結合使用,幫助減少或消除PCR雜帶問題。
]]>在聊壓縮時長之前,需先對試管(Tube)/模塊(Block)控溫;普通/快速模式幾個概念進行簡介。下面以柏恒Q9606為圖例進行說明。
圖1
模塊控溫:反應升降溫時,以模塊的實時溫度為準。
試管控溫:反應升降溫時,以反應管內試劑的實時溫度為準。
圖2
圖3
實驗編輯完成后,點擊運行按鈕會彈出提示框(如圖2),選擇快速模式還是普通模式。
以圖3程序為例說明:
快速模式:儀器運行的升降溫速率為8℃/s,標示升降溫速率的全額運行實驗。
普通模式:儀器運行的升降溫速率為4℃/s,標示升降溫速率的半額運行實驗。
不同的應用場景選擇不同的反應模式組合,下面來分享一下如何調試快速試劑的反應程序。
首先,儀器運行設置選擇快速模式+模塊控溫的組合將反應時長進行極致壓縮。其次,在總時長不變的前提下合理分配循環段變性與退火延伸的時長。最后,在其次篩選出可用反應程序的基礎上進行微調,再一次縮短反應段的時長或在總時長允許的條件下適當延長反應段的時長以達到最優的反應效果。
因為快速試劑所用的擴增酶相較于普通試劑的酶來說有著更為快速的延伸速度,所以在設置退火延伸段反應時長時可以進行大幅度的壓縮。在壓縮變性反應時長時須注意,因為選用的是模塊控溫,如果變性時長過短會造成試劑的實際溫度不足95℃或95℃維持時長不夠而造成模板的解雙鏈不充分進而影響信號的積累,所以變性反應段的時長不宜過度極端。
柏恒Q9600系列可提供最快8℃/sec的升降溫速率,且具備等溫差梯度功能(如圖4),滿足常規試劑開發、檢測的同時也為快速試劑提供了一個很好的反應平臺。
圖4
]]>親愛的科研卷王們:
還在為實驗室預算摳破頭?
隔壁課題組又曬新設備讓你酸到變形?
現在!立刻!馬上!
柏恒科技618王炸福利直接幫你裝備升級!
2025.6.16-6.26 期間
采購指定設備即可獲贈配套裝備
(贈品數量有限,先到先得)
科研人拼手速的時候到了!
Go!Go!Go!
第一彈:買?實時熒光定量PCR儀(Q9600 Pro/Q9600 系列),贈送?恒溫混勻儀?!
混樣速度提升50%,手殘黨也能做出完美數據
第二彈:?超微量分光光度計?下單,直接打包帶走離心機+金屬浴?!
樣本處理一條龍,再也不用到處借設備
線上咨詢:服務熱線0571-88992477,咨詢活動詳細信息。
溫馨提示:贈品限量,先付先得!以付款順序為準,手慢無!
立即行動,讓你的實驗室裝備升級!
(本文最終解釋權歸杭州柏恒科技有限公司所有)
【終極彩蛋】轉發就送實驗人必備神器!
▌ 彩蛋規則(手慢無!)
1⃣ 轉發至朋友圈(不屏蔽+保留3天)
2⃣ 截圖發給客服,立即解鎖彩蛋福利:
? 第1-20名:贈送柏恒手持移液器(價值¥480)
? 第21-50名:贈送實驗室專用保溫杯(價值¥158)
重要提示:
? 彩蛋活動總名額限50位,以提供截圖時間為準;
? 禮品將于活動結束后7個工作日內統一寄送;
? 本活動最終解釋權歸柏恒科技所有。
(小貼士:建議設置朋友圈提醒,確保轉發內容完整保留3天哦~)
本次活動專為終端客戶打造,為終端客戶帶來多重科研福利
]]>主要特點:
1.能夠測量微量樣品的吸光度,通常在納升至微升級別。
2.高靈敏度和精確度,能夠準確測量核酸和蛋白質的濃度。
3.通常采用紫外-可見分光光度法進行測量。
4.一般具有緊湊的設計和易操作的特點。
工作原理:
核酸和蛋白質在紫外-可見光波長范圍內具有特定的吸光特性。
通過將樣品放置在光路中,利用光源照射樣品,測量樣品在特定波長下透射或反射的光強,即吸光度。根據樣品在特定波長下的吸光度值,結合已知的標準曲線或專門的軟件,可以計算出核酸或蛋白質的濃度。
通過測量特定波長下的光密度(OD值),可以間接計算出核酸的濃度。
以下是該方法的基本原理和操作步驟:
OD值的含義
OD是optical density的縮寫,表示被檢測物質吸收的光密度。由于核酸中的堿基具有共雙鍵結構,因此它們具有紫外光吸收特性。
不同波長的吸收峰
OD260:DNA雙鏈的吸收峰,主要反映DNA的濃度。
OD280:芳香族氨基酸的吸收峰,主要用于判斷蛋白質污染程度。
OD230:核酸提取過程中使用的鹽離子在230nm處有吸收峰,如果OD230很高,說明鹽離子濃度較高。
純度判斷
OD260/OD280的比值用于判斷RNA或DNA的純度。高純度的DNA比值應該在1.8-2.0之間。
如果比值低于1.8,說明蛋白質污染較嚴重;高于2.0,則說明可能有RNA污染。
操作步驟
準備核酸樣品:將待測的DNA或RNA樣品溶解在適當濃度的緩沖液中。
測量OD值:使用產微量分光光度計,分別測量260nm、280nm和230nm處的光密度。
計算濃度:根據已知的摩爾消光系數,計算DNA或RNA的濃度。
注意事項
實驗過程中要避免蛋白質和鹽離子的污染,否則會影響結果的準確性。
測量時要保持樣品池和空白池的清潔,避免雜質干擾。
常見的用途
無論在物理學、化學、生物學、醫學、材料學、環境科學等科學研究領域 ,還是在化工、醫藥、環境檢測、冶金等現代生產與管理部門 ,紫外可見分光光度計督有廣泛而重要的應用。分光光度計就是利用分光光度法對物質進行定量定性分析的儀器,常用于核酸,蛋白定量以及細菌生長濃度的定量。
超微量分光光度計已成為現代分子生物實驗室常規儀器。
常用于核酸,蛋白定量以及細菌生長濃度的定量。
核酸的定量
核酸的定量是超微量分光光度計使用頻率最高的功能。可以定量溶于緩沖液的寡核苷酸,單鏈、雙鏈DNA,以及RNA。
核酸的最高吸收峰的吸收波長260 nm。每種核酸的分子構成不一,因此其換算系數不同。定量不同類型的核酸,事先要選擇對應的系數。
如:1OD 的吸光值分別相當于50μg/ml的dsDNA,37μg/ml的ssDNA,40μg/ml的RNA,30μg/ml的Olig。測試后的吸光值經過上述系數的換算,從而得出相應的樣品濃度。
測試前,選擇正確的程序,輸入原液和稀釋液的體積,爾后測試空白液和樣品液。然而,實驗并非一帆風順。
讀數不穩定可能是實驗者最頭痛的問題。靈敏度越高的儀器,表現出的吸光值漂移越大。
除了核酸濃度,分光光度計同時顯示幾個非常重要的比值表示樣品的純度,如A260/A280的比值,用于評估樣品的純度,因為蛋白的吸收峰是280nm。
純凈的樣品,比值大于1.8(DNA)或者2.0(RNA)。如果比值低于1.8 或者2.0,表示存在蛋白質或者酚類物質的影響。A230表示樣品中存在一些污染物,如碳水化合物,多肽,苯酚等,較純凈的核酸A260/A230的比值大于2.0。
A320檢測溶液的混濁度和其他干擾因子。純樣品,A320一般是0。
蛋白質直接定量
是在280nm波長,直接測試蛋白。選擇Warburg 公式,光度計可以直接顯示出樣品的濃度,或者是選擇相應的換算方法,將吸光值轉換為樣品濃度。
蛋白質測定過程非常簡單,先測試空白液,然后直接測試蛋白質。由于緩沖液中存在一些雜質,一般要消除320nm 的“背景”信息,設定此功能“開”。與測試核酸類似,要求A280的吸光值至少大于0.1A,最佳的線性范圍在1.0-1.5 之間。
實驗中選擇Warburg 公式顯示樣品濃度時,發現讀數“漂移”。這是一個正常的現象。事實上,只要觀察A280的吸光值的變化范圍不超過1%,表明結果非常穩定。漂移的原因是因為Warburg 公式吸光值換算成濃度,乘以一定的系數,只要吸光值有少許改變,濃度就會被放大,從而顯得結果很不穩定。
蛋白質直接定量方法,適合測試較純凈、成分相對單一的蛋白質。紫外直接定量法相對于比色法來說,速度快,操作簡單;但是容易受到平行物質的干擾,如DNA的干擾;另外敏感度低,要求蛋白的濃度較高。
OD 600
實驗室確定細菌生長密度和生長期,多根據經驗和目測推斷細菌的生長密度。在遇到要求較高的實驗,需要采用分光光度計準確測定細菌細胞密度。
OD600是追蹤液體培養物中微生物生長的標準方法。以未加菌液的培養液作為空白液,之后定量培養后的含菌培養液。為了保證正確操作,必須針對每種微生物和每臺儀器用顯微鏡進行細胞計數,做出校正曲線。實驗中偶爾會出現菌液的OD值出現負值,原因是采用了顯色的培養基,即細菌培養一段時間后,與培養基反應,發生變色反應。
另外,需注意的是,測試的樣品不能離心,保持細菌懸浮狀態。
]]>